Izolace a charakterizace mikrobiálních degradérů aromaticko-alifatických polyesterů

Abstract

Práce se zaměřuje na kultivaci, identifikaci a charakterizaci mikrobiálních degradérů poly(butylen adipát-co-tereftalátu) (PBAT), přítomných ve svrchní části půdy vzorkované v okolí Zlína. Kultivace degradérů PBAT byla prováděna na tuhých živných médiích se submikročásticemi PBAT, degradéři byli určováni metodou prosvětlených zón. V rámci práce bylo využito molekulárně biologických metod. Izolace DNA byla prováděna pomocí metodiky s rozpouštědly chloroform/izoamylalkohol (24:1) a komerčních kitů. Jako nejvhodnější varianta polymerázové řetězové reakce (PCR) byla identifikována modifikace Touchdown protokolu, a použití specifických primerů pro aktinomycety S-C-Act-235 a S-C-Act-878. V rámci práce byly identifikovány tyto termofilní aktinomycety: Thermobispora bispora, Actinomadura rubrobrunea a Thermomonospora sp.. Dále byly identifikovány mikroorganismy vyskytující se v těsné blízkosti degradérů, příkladem jsou Geobacillus sp. a Geobacillus thermoglucosidasius. V práci byla využita metodika denaturační gelové gradientové elektroforézy (DGGE) pro charakterizaci směsné mikrobiální kultury vyskytující se v místě kolonií aktinomycet. V práci byla izolována bakterie s širokým teplotním růstovým optimem (25 C° až 58 °C) degradující PBAT. Práce dokazuje, že v reálné složce životního prostředí půdě, je možné nalézt přirozeně se vyskytující degradéry PBAT, konkrétně termofilní aktinomycety.